Madurella
mycetomatis

Malbranchea
arcuata - cinnamomea - pulchella

Mammaria
echinobotryoides

Mariannaea
camptospora - elegans

Memnoniella
echinata

Merimbla
ingelheimensis

Metarrhizium
anisopliae - flavoviride

Microascus
albonigrescens - desmosporus - pyramidus - senegalensis - trigonosporus

Microdochium
bolleyi - nivale

Microsporum
audouinii - boullardii - canis - cookei - equinum - ferrugineum - fulvum - gypseum - nanum - persicolor - praecox - racemosum - rivalieri - vanbreuseghemii

Mollisia
ventosa

Monascus
ruber

Moniliella
suaveolens

Monilinia
fructigena

Monodictys
asperospora - castaneae - nigrosperma

Mortierella
alpina - hyalina - isabellina - lignicola - polycephala - ramanniana

Mucor
circinelloides - hiemalis - indicus - mucedo - plumbeus - racemosus - ramosissimus - saturninus

Myceliophthora
lutea - thermophila - vellerea

Mycotypha
africana - microspora

Myriodontium
keratinophilum

Myrothecium
cinctum - roridum - verrucaria

Myxotrichum
chartarum - deflexum