Sagenoma
ryukyuense

Sagenomella
bohemica - diversispora - humicola

Saitoa
japonica

Sarcodontia
setosa

Sarcopodium
circinosetiferum - macalpinae

Sarocladium
oryzae

Satchmopsis
brasilensis

Scedosporium
prolificans

Scheleobrachea
sacchari

Schizonella
cocconii - melanogramma

Schizophyllum
commune - umbrinum

Schizopora
flavipora

Scleroderma
verrucosum

Sclerotinia
allii - antarctica - minor - miyabeana - sclerotiorum - spermophila - sulcata - trifoliorum

Sclerotium
cepivorum - hydrophilum - perniciosum - tulipae - tuliparum - wakkeri

Scolecobasidiella
tropicalis

Scolecobasidium
capsiforme - dendroides - excentricum - fusarioideum - gyrocarpi - salinum - terreum

Scopularia
corsicana - venusta

Scopulariopsis
acremonium - brevicaulis - brumptii - canadensis - carbonaria - chartarum - coprophila - croci - flava - fusca - humicola - koningii - parva - sphaerospora - stercoraria

Scopuloides
hydnoides - leprosa

Scytalidium
album - aurantiacum - circinatum - dimidiatum - flavobrunneum - hyalinum - lignicola - terminale - uredinicola

Scytinostroma
africanogalactinum - alutum - caudisporum - crispulum - decidens - duriusculum - eurasiaticogalactinum - hemidichophyticum - intextum - jacksonii - mediterraneense - microspermum - neogalactinum - ochroleucum - phaeosarcum - pseudopraestans - renisporum

Seaverinia
geranii

Sepedonium
ampullosporum - chlorinum

Septocylindrium
acutum

Septofusidium
herbarum

Septogloeum
gillii

Septomyrothecium
uniseptatum

Septonema
chaetospira - secedens

Septoria
apiicola

Septotinia
podophyllina - populiperda

Serpula
himantioides - incrassata - lacrymans

Sesquicillium
candelabrum

Setosphaeria
monoceras - pedicellata - rostrata - turcica

Shanorella
spirotricha

Sirococcus
strobilinus

Sistotrema
brinkmannii - coroniferum - coronilla - raduloides - sp.

Sistotremastrum
niveocremeum

Soloacrospora
microverrucosa

Sordaria
brevicollis - fimicola - inaequalis - macrospora

Spegazzinia
ornata - tessarthra

Speiropsis
scopiformis

Spermospora
avenae

Sphaeridium
candidum

Sphaeronaemella
fimicola

Sphaeropsis
dalmatica - malorum - sapinae

Sphaerostilbella
aureonitens

Spiromastix
grisea - tentaculatum - warcupii

Spirosphaera
beverwijkiana - floriformis - minuta

Spondylocladiopsis
cupulicola

Sporendonema
casei - purpurascens

Sporidesmium
densum - folliculatum - goidanichii - vagum

Sporocybe
hybrida

Sporormiella
octomera

Sporothrix
curviconia - cyanescens - foliorum - fungorum - ghanensis - inflata - insectorum - pallida - ramosissima - schenckii

Sporotrichum
aurantiacum

Stachybotrys
bisbyi - chartarum - cylindrospora - dichroa - kampalensis - longispora - nilagirica - oenanthes - parvispora - theobromae

Stagonospora
typhoidearum

Staheliella
nodosa

Staphylotrichum
coccosporum

Stecchericium
seriatum

Steccherinum
bourdotii - confragosum - fimbriatum - meridiochraceum - ochraceum - oreophilum - queletii - rhois - robustius - scruposum

Stemphylium
alternariae - globuliferum - lancipes - majusculum - sarciniforme - verruculosum - vesicarium

Stereum
australe - complicatum - gausapatum - hirsutum - insignitum - lobatum - ostrea - peculiare - rameale - reflexulum - rugosum - sanguinolentum - striatum - subtomentosum

Stilbella
aciculosa - annulata

Strasseria
geniculata

Streptobotrys
dicentrae

Streptotinia
caulophylli

Stromatinia
gladioli

Stropharia
aeruginosa - aurantiaca - rugoso-annulata

Strumella
griseola

Subulispora
britannica - procurvata

Suillus
brevipes - collinitus - cothurnatus - luteus - variegatus

Symbiotaphrina
buchneri

Sympodioclathra
globosa

Syncephalastrum
racemosum

Syzigites
megalocarpus