Cacumisporium
capitulatum

Calcarisporium
arbuscula - thermophilum

Calceomyces
lacunosus

Caldariomyces
fumago

Calonectria
kyotensis - pyrochroa - quinqueseptata - spathulata - variabilis

Caloscypha
fulgens

Calyptella
campanula

Camarops
lutea - polysperma

Camarosporium
aequivocum - atriplicis - propinquum

Camposporium
antennatum

Campylospora
filicladia - parvula

Canariomyces
notabilis

Cancellidium
applanatum

Capronia
pinicola

Catenaria
anguillulae

Cephaliophora
irregularis - tropica

Cephaloascus
fragrans

Cephalotrichum
microsporum - nanum - purpureofuscum - stemonitis

Ceratobasidium
cereale - cornigerum - ramicola

Ceratocystiopsis
falcata - minuta - pallidobrunnea

Ceratocystis
adiposa - allantospora - arborea - autographa - brunneociliata - cainii - clavata - coronata - davidsonii - fimbriata - ips - moniliformis - olivacea - paradoxa - piceae - pilifera - prolifera - pseudoeurophioides - radicicola - stenoceras - tetropii

Cercospora
ampelopsidis - apii - astragali - berteroae - beticola - bizzozzeriana - canescens - caricis - citrullina - fusimaculans - gossypina - hayi - kikuchii - longipes - longissima - malvicola - manihobae - microsora - olivascens - plumbaginea - rautensis - ricinella - setariae - xanthosomatis - zebrina

Cercosporella
mori - rubi

Cercosporidium
bolleanum - henningsii

Cerebella
andropogonis

Ceuthospora
phacidioides

Chaetocladium
brefeldii - jonesii

Chaetoconis
polygoni

Chaetomella
acutiseta - circinoseta - raphigera

Chaetomidium
arxii - cephalothecoides - fimeti - pilosum

Chaetomium
anatolicum - anguipilium - angustispirale - apiculatum - aterrimum - atrobrunneum - aureum - biporatum - bostrychodes - brasiliense - caprinum - carinthiacum - causiaeformis - circinatum - coarctatum - cochliodes - convolutum - crispatum - cuniculorum - cupreum - cymbiforme - deceptivum - deltosporum - distortum - dreyfussii - elatum - erectum - erraticum - flavigenum - funicola - fusiforme - fusisporale - fusisporum - fusum - gangligerum - gelasinosporum - globisporum - globosum - gracile - hamadae - heterosporum - hexagonosporum - hispanicum - homopilatum - hyaloperidium - indicum - intricatum - irregulare - jabalpurense - jodhpurense - lentum - lucknowense - luteum - madrasense - medusarum - megalocarpum - megasporum - mollicellum - mollipilium - montblancense - muelleri - multispirale - murorum - nepalense - nigricolor - nozdrenkoae - oblatum - pachypodioides - paucipilum - perlucidum - purpurascens - quadrangulatum - raii - reflexum - repens - retardatum - reticulopilium - robustum - semen-citrulli - senegalense - serpentinum - sphaerale - spinosum - spirale - spiralotrichum - spirilliferum - spirochaete - spirogyrum - strumarium - subaffine - subcircinatum - subglobosum - subspirale - subspirilliferum - succineum - sulphureum - tetrasporum - thermophilum - torulosum - trigonosporum - trilaterale - uniapiculatum - variosporum - variostiolatum - virescens

Chaetopsina
fulva

Chaetopyrena
hesperidum

Chaetosartorya
chrysella

Chaetospermum
carneum

Chaetosphaeria
anglica - inaequalis - myriocarpa - talbotii

Chaetosphaeronema
hispidulum

Chaetospora
quezelii

Chalara
novae-zelandiae

Chalaropsis
thielavioides

Chlamydoabsidia
padenii

Chlamydomyces
palmarum

Chlamydosporium
submersum

Chloridium
virescens

Choanephora
cucurbitarum - infundibulifera

Chondrostereum
purpureum

Chromelosporium
glomerulosum - macrospermum

Chrysosporium
carmichaelii - indicum - inops - kreiselii - lucknowense - mephiticum - merdarium - pseudomerdarium - synchronum - tropicum - xerophilum

Ciliochorella
mangiferae

Cintractia
limitata

Circinella
minor - mucoroides - muscae - naumovii - rigida - simplex - umbellata

Circinotrichum
fertile

Cladobotryum
dendroides - varium

Cladorrhinum
foecundissimum

Cladosporium
aecidiicola - allii - chlorocephalum - cladosporioides - colocasiae - cucumerinum - echinulatum - elatum - gallicola - gossypiicola - herbarum - langeronii - macrocarpum - magnusianum - malorum - multigeniculatum - musae - oxysporum - phlei - scillae - sphaerospermum - staurophorum - tenuissimum - uredinicola - variabile

Clasterosporium
flexum

Clathrospora
diplospora - elynae

Claussenomyces
atrovirens

Clavariopsis
bulbosa

Clavatospora
filiformis

Claviceps
paspali - purpurea

Clonostachys
compactiuscula

Cochliobolus
aberrans - akaii - akaiiensis - australiensis - bicolor - carbonum - chloridis - cymbopogonis - cynodontis - dactyloctenii - eleusines - ellisii - eragrostidis - geniculatus - hawaiiensis - heteropogonis - heterostrophus - intermedius - kusanoi - lunatus - melinidis - microlaenae - miyabeanus - neergaardii - nodulosus - pallescens - peregianensis - perotidis - ravenelii - sativus - setariae - spicifer - tuberculatus - verruculosus - victoriae

Codinaea
dendroidea - parva - simplex

Coemansia
aciculifera - erecta - mojavensis - nantahalensis - pectinata - reversa - spiralis

Cokeromyces
recurvatus

Coleophoma
crateriformis - empetri

Colletotrichum
acutatum - ampelinum - annonicola - capsici - caudatum - chlorophyti - circinans - coccodes - coffeanum - corchori - crassipes - curcumae - curvatum - dematium - destructivum - fragariae - gloeosporioides - gossypii - graminicola - higginsianum - indicum - kahawae - lindemuthianum - lini - malvarum - musae - orbiculare - orchidearum - piperis - sublineolum - tabacum - trichellum - truncatum - typhae

Collybia
drucei

Conidiobolus
adiaeretus - coronatus - couchii - firmipilleus - globuliferus - heterosporus - humicola - khandalensis - lachnodes - lamprauges - lichenicola - megalotocus - mycophagus - mycophilus - nanodes - osmodes - pumilus - stromoideus - terrestris - thromboides

Coniella
australiensis - castaneicola - fragariae - granati - musaiaensis - petrakii

Coniochaeta
angustispora - leucoplaca - nepalica - nodulisporioides - polysperma - tetraspora

Coniochaetidium
boothii

Coniophora
puteana

Conioscypha
japonica - varia

Coniothyrinula
clematidis-rectae

Coniothyrium
acaciae - coffeae - conorum - fuckelii - minitans - olivaceum

Conoplea
mangenotii

Cooksonomyces
banksiae

Coprinus
amphibius - cinereus - congregatus - hexagonosporus - lagopides - radiatus - trisporus - utrifer

Cordana
ellipsoidea - pauciseptata

Cordyceps
gracilis

Coremiella
cubispora

Coriolopsis
occidentalis

Coriolus
versicolor

Corollospora
maritima

Corticium
evolvens - fuciforme - rolfsii - salmonicolor - utriculicum

Corynascella
humicola

Corynascus
novoguineensis - sepedonium - thermophilus

Corynespora
cassiicola - citricola - smithii

Coryneum
modonium - terrophilum

Cristaspora
arxii

Crumenulopsis
sororia

Cryphonectria
cubensis - gyrosa - havanensis - parasitica

Cryptendoxyla
hypophloia

Cryptocline
cinerescens - conigena - cyclaminis

Cryptophiale
udagawae

Cryptosporiopsis
tarraconensis

Ctenomyces
serratus

Culicinomyces
clavisporus

Cunninghamella
blakesleeana - dalmatica - echinulata - elegans - phaeospora

Curvularia
affinis - andropogonis - borreriae - brachyspora - catenulata - clavata - comoriensis - crepinii - deightonii - fallax - gudauskasii - harveyi - inaequalis - ischaemi - leonensis - lunata - oryzae - ovoidea - penniseti - prasadii - protuberata - richardiae - robusta - senegalensis - sorghina - trifolii - uncinata - verruciformis

Cyathus
olla

Cylindrocarpon
carneum - congoense - decumbens - destructans - didymum - effusum - gracile - ianthothele - lichenicola - liriodendri - lucidum - macroconidialis - magnusianum - musae - obtusisporum - olidum - tenue - theobromicola - victoriae

Cylindrocladiella
camelliae - elegans - novae-zelandiae - parva

Cylindrocladium
camelliae - candelabrum - clavatum - colhounii - floridanum - ilicicola - lanceolatum - pteridis - quinqueseptatum - scoparium - spathiphylli

Cylindrodendrum
album

Cyrenella
elegans

Cytoplea
arundinacea

Cytosphaera
mangiferae

Cytospora
ambiens - chrysosperma - eriobotryae - eucalypticola - eutypelloides - leucostoma - magnoliae