Sagenomella
diversispora - griseoviridis - humicola - striatispora

Saprolegnia
australis - crustosa - diclina - eccentrica - ferax - hypogyna - litoralis - megasperma - mixta - monoica - parasitica - terrestris - turfosa

Sarcinomyces
crustaceus

Sarcopodium
vanillae

Sarea
difformis - resinae

Sarocladium
oryzae

Sarophorum
palmicola

Satchmopsis
brasiliensis

Schizophyllum
commune - radiatum

Schizothecium
curvisporum - tetrasporum

Schizothyrioma
ptarmicae

Schizotrichum
conocarpi

Scirrhia
acicola

Sclerococcum
sphaerale

Sclerotinia
convoluta - draytonii - homoeocarpa - minor - ricini - sclerotiorum - trifoliorum

Sclerotium
cepivorum - delphinii - hydrophilum - wakkeri

Scolecobasidiella
avellanea

Scolecobasidium
anellii - arenarium - constrictum - humicola - salinum - terreum - variabile - verruculosum

Scoliolegnia
blelhamensis - depauperata - subeccentrica

Scopulariopsis
acremonium - asperula - brevicaulis - brumptii - candida - carbonaria - chartarum - coprophila - croci - flava - fusca - halophilica - hibernica - koningii - murina - parva - sphaerospora

Scytalidium
acidophilum - album - aurantiacum - flavobrunneum - hyalinum - japonicum - lignicola - thermophilum

Seimatosporium
discosioides - falcatum - fusisporum - grevilleae - hakeae - hypericinum - lichenicola - mariae - vaccinii

Seiridium
cardinale - cupressi

Sepedonium
ampullosporum

Septocyta
ruborum

Septonema
dendryphioides

Septoria
agropyrina - apiicola - atropurpurea - chrysanthemella - cucurbitacearum - leucanthemi - musiva - passerinii - petroselini - rhamni-catharticae - veronicae

Septoriella
junci

Sesquicillium
buxi - candelabrum - microsporum

Setosphaeria
holmii - khartoumensis - monoceras - pedicellata - prolata - rostrata - turcica

Setosporella
mahmoudii

Sibirina
fungicola

Sirococcus
conigenus

Sirodesmium
diversum

Sordaria
alcina - arctica - brevicollis - destruens - fimicola - goundaensis - humana - islandica - lappae - macrospora - superba - tenerifae

Sorosporium
heteropogonicola

Spadicoides
stoveri

Spegazzinia
intermedia - lobulata - sundara - tessarthra

Spermospora
avenae - lolii

Sphaceloma
anacardii - barleriicola - flacourtiae - ichnocarpi - ixorae - manihoticola - semecarpi

Sphacelotheca
destruens

Sphaeridium
candidum

Sphaerodes
compressa - fimicola - micropertusa

Sphaeronaema
allahabadense - indicum - sesami

Sphaeropsis
sapinea - tumefaciens

Sphaerostilbella
lutea

Sphaerulina
mimosae-pigrae

Spicellum
roseum

Spilocaea
pyracanthae

Spiromastix
warcupii

Sporendonema
casei - purpurascens

Sporidesmium
flexum - goidanichii - tropicale

Sporodiniella
umbellata

Sporophora
toruliformis

Sporormiella
australis - intermedia - isomera - minima

Spororminula
tenerifae

Sporothrix
cyanescens - inflata - ramosissima - rectidentata - schenckii

Sporotrichum
dimorphosporum - pruinosum - pulverulentum

Stachybotrys
atra - bisbyi - chartarum - cylindrospora - dichroa - oenanthes - parvispora

Stagonospora
curtsii - meliloti - pteridiicola

Staheliella
nodosa

Staphylotrichum
coccosporum

Stauronema
cruciferum

Stegonsporium
pyriforme

Stemphylium
dendriticum - globuliferum - lancipes - lycopersici - majusculum - maritimum - sarciniforme - solani - vesicarium - xanthosomatis

Stenella
adeniae - araguata

Stephanoascus
ciferrii

Stephanosporium
cereale

Stereum
hirsutum

Stigmina
carpophila - eucalypti - longispora - millettiae - platani

Stilbella
aciculosa - bulbicola - buquetii - erythrocephala - fimetaria - proliferans - thermophila

Stilbum
buloloense

Strasseria
geniculata

Strattonia
carbonaria

Streptotheca
psychrophila

Streptotinia
caulophylli

Stromatinia
gladioli - narcissi

Subulispora
procurvata - rectilineata

Sutravarana
samala

Suttonina
guatemaltica

Sydowia
polyspora

Sympodiella
multiseptata

Syncephalastrum
monosporum - racemosum

Syncephalis
cornu - depressa - hypogena - nana - nodosa - plumigaleata - sphaerica

Synnematium
jonesii

Syspastospora
parasitica

Syzygites
megalocarpus