Macrophoma
lageniformis - mangiferae - sugi

Macrophomina
phaseolina

Magnaporthe
salvinii

Malbranchea
albolutea - arcuata - aurantiaca - chrysosporioidea - circinata - flava - flavorosea - flocciformis - fulva - gypsea - multicolor - pulchella - sulfurea

Mammaria
echinobotryoides

Marasmius
kroumirensis - palmivorus

Mariannaea
camptospora - elegans

Marssonina
brunnea

Martensiomyces
pterosporus

Massarina
eburnea

Massariothea
shawiae

Matsushimaea
fertilis

Mauginiella
scaettae

Melanconis
alni

Melanconium
atrum - stromaticum

Melanocarpus
albomyces

Melanopsamma
pomiformis

Melanospora
brevirostris - damnosa - phaseoli - zamiae

Meloderma
desmazieri

Memnoniella
echinata - levispora

Meria
laricis

Merimbla
ingelheimense

Mesobotrys
simplex

Metarhizium
anisopliae - brunneum - flavoviride

Microascus
albonigrescens - cinereus - cirrosus - doguetii - longirostris - manginii - pyramidus - senegalensis - trigonosporus

Microdochium
bolleyi - dimerum - oryzae - panattonianum - tabacinum

Micronectriella
cucumeris

Microsphaeropsis
arundinis

Microxyphiella
hibiscifolia

Minimedusa
polyspora

Moesziomyces
penicillariae

Monacrosporium
bembicodes - cystosporum - ellipsosporum - globosporum - mutabile - rutgeriense - salinum

Monascus
eremophilus - floridanus - pilosus - purpureus - ruber

Moniliella
acetoabutans - tomentosa

Monilinia
fructicola - fructigena - laxa

Moniliophthora
roreri

Monochaetia
dimorphospora - lutea - saccardoi

Monocillium
indicum

Monodictys
castaneae - fluctuata - levis

Monodisma
fragilis

Monographella
nivalis

Monosporascus
cannonballus - eutypoides

Monotosporella
setosa

Montagnula
phragmospora

Mortierella
alpina - ambigua - bainieri - camargensis - capitata - chlamydospora - echinosphaera - elongata - epigama - exigua - gamsii - globulifera - humilis - hyalina - hygrophila - indohii - isabellina - jenkinii - marburgensis - multidivaricata - nana - nantahalensis - ovata - parvispora - polycephala - pusilla - ramanniana - reticulata - sclerotiella - stylospora - turficola - umbellata - verrucosa - vinacea - wolfii - zychae

Mucobasispora
tarikii

Mucor
adventitius - aligarensis - amphibiorum - azygosporus - bacilliformis - bainieri - chibinensis - christianensis - circinelloides - faisalabadensis - flavus - fuscus - genevensis - gigasporus - guilliermondii - hiemalis - inaequisporus - indicus - minutus - mousanensis - mucedo - oblongisporus - piriformis - plumbeus - racemosus - ramosissimus - recurvus - saturninus - strictus - subtilissimus - tuberculisporus - variabilis - varians - variosporus

Myceliophthora
lutea - thermophila - vellerea

Mycena
citricolor

Mycoarachis
inversa

Mycoarctium
ciliatum

Mycocentrospora
acerina

Mycogone
perniciosa - rosea

Mycoleptodiscus
lateralis - sphaericus - unilateralis

Mycosphaerella
berkeleyi - chrysanthemi - cruenta - dearnessii - deightonii - delegatensis - fijiensis - fragariae - gibsonii - graminicola - macrospora - mori - musicola - pini - pinodes - praecox - sesami

Mycosylva
clarkii

Mycotribulus
mirabilis

Mycotypha
africana - indica - microspora

Mycovellosiella
brachycarpa - ferruginea - nattrassii

Myriodontium
keratinophilum

Myrothecium
carmichaelii - cinctum - gramineum - inundatum - lachastrae - leucotrichum - masonii - prestonii - roridum - verrucaria

Myxotrichum
aeruginosum - deflexum